Utilizzo Cluster R&D
Come utilizzare il Cluster
Per utilizzare le risorse del cluster occorre fare login sulla macchina rd-ui.cnaf.infn.it
, utilizzando come credenziali lo stesso username e password utilizzato per il login su bastion.cnaf.infn.it
.
La prima volta che viene fatto il login sulla UI, viene creata automaticamente la home directory dell'utente, contenente un template per la sottomissione dei job e un breve howto con i comandi essenziali di LSF. Questa directory non è locale alla UI, ma è condivisa fra tutti gli host del cluster. In questo modo i file eseguibili che vengono creati sulla UI, sono immediatamente visibili anche ai server fisici che eseguiranno il job, senza necessità di eseguire trasferimenti di file; allo stesso modo gli output dei job prodotti sui server fisici sono subito disponibili anche sulla UI.
Nel cluster R&D i compilatori e le librerie sono organizzare mediante moduli software. Per elencare i moduli disponibili, utilizzare:
$ module avail
Per caricare uno o più moduli:
$ module load modulo1 modulo2
Per elencare i moduli attualmente caricati:
$ module list
Per scaricare un modulo:
$ module unload modulo
Per condividere dati con altri utenti è disponibile una lo spazio $SCRATCH
, uno spazio disco condiviso fra
tutte le macchine, che ha gli stessi permessi della directory /tmp dei sistemi Linux.
Questo spazio viene periodicamente ripulito eliminando i file che non vengono acceduti per 30 giorni.
Per avere a disposizione questo spazio, caricare il modulo profile:
$ module load profile